Każdy system operacyjny wymaga odpowiedniego oprogramowania, które z upływem czasu podlega ciągłemu ulepszaniu. Zarówno dla Windowsa jak i linuksa powszechnie dostępne są programy  których to dostępność decyduje o sukcesie danego systemu operacyjnego. Wraz z rozwojem oprogramowania oraz internetu pojawiły się pierwsze zagrożenia - wirusy, a wraz z nimi powstały programy je zwalczające czyli antywirusy. W Polsce najpopularniejszym programem antywirusowym jest avast! w (Professional oraz Home). Rozwój internetu umożliwiał wymianę plików między użytkownikami, z tego założenia wyszli producenci programów typu p2p które umożliwiły powszechną wymianę plików w interecie. Najpopularniejsze z nich to: BearShare dostępny również w wersji lite oraz Hamachi który umożliwia, oprócz zwykłej wymiany plików na tworzenie własnych sieci wirtualnych. .